"种子"说 阿那克萨戈拉深受伊奥尼亚学派唯物主义思想影响，但他又不满足于用某一种具体物质或元素作为万物本原的主张，因为这不能解决一和多的关系问题。他提出了自己的种子说，认为"种子"有各种不同的性质，数目无限多，体积无限小，是构成世界万物的最初元素；种子具有各种形式、颜色和气味，它们的结合构成了世界上千差万别的事物，头发是由头发的种子、血是由血的种子、金子是由金子的种子构成的，所谓事物的产生和消灭实际上是种子的结合和分离；各种不同的种子不是孤立地独立存在,而是混合在一起的,由种子构成的世界中的一切事物也不是彼此孤立的，没有一件东西能绝对与其他的东西分开,热不能与冷分开,白不能与黑分开，所以热能变成冷，白雪能变成浊水，从吃的食物中能长出头发、血管、肌肉等等；事物性质的区别完全取决于该事物占优势的种子的性质；由于种子是无限的，它们的结合和分离也是无限的，因而事物性质和种类的变化也就无穷无尽。
"奴斯"说 阿那克萨戈拉认为种子本身是不动的，推动种子的结合和分离的力量在于种子之外的一种东西，他称之为"奴斯"。他认为，宇宙原是无数无穷小的种子的混合体,由于奴斯的作用,使原始的混合体发生旋涡运动，这个运动首先从一小点开始，然后逐步扩大，产生星辰、太阳、月亮、气体等等。这种旋涡运动的结果，使稀与浓、 热与冷、 暗与明、干与湿分开，于是浓的、冷的、湿的和暗的结合为大地，而稀的、热的、干的和明的结合为高空，从而构成了有秩序的宇宙。
在希腊文中,"奴斯"本义为心灵,转义为理性。阿那克萨戈拉以此来表述万物的最后动因。他认为，奴斯和任何个别事物不同，它不和别的事物相混，是独立自在的；奴斯是事物中最稀最纯的,它能认知一切事物;奴斯是运动的源泉，宇宙各种天体都是由奴斯推动的，过去、现在和将来的一切东西都是由奴斯安排的。
阿那克萨戈拉的"种子说"克服了恩培多克勒"四根说"的局限性，使朴素唯物主义前进了一步，为原子唯物论的产生作了准备。但是，他在以"奴斯"解释万物的动因时，也陷入了"外因论"。他的"奴斯"一词被后来的苏格拉底、柏拉图，一直到G.W.F.黑格尔说成是精神的实体，使"奴斯"变成了唯心主义的术语。
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